Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CAMTA1Q9Y6Y1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAMTA1Q9Y6Y1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms