Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
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