Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAD1L1Q9Y6D9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAD1L1Q9Y6D9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms