Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
DCAF1Q9Y4B6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
DCAF1Q9Y4B6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
DCAF1Q9Y4B6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
DCAF1Q9Y4B6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms