Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRRAPQ9Y4A5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRRAPQ9Y4A5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms