Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED5Q9Y3A6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED5Q9Y3A6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms