Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX24Q9Y343 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms