Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms