Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNEQ9Y223 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GNEQ9Y223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms