Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN3Q9UPQ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms