Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFSF18Q9UNG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms