Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN16Q9UKR8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms