Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1LQ9UGC7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms