Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX2Q9UBZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX2Q9UBZ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms