Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PEF1Q9UBV8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms