Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC17A7Q9P2U7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC17A7Q9P2U7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC17A7Q9P2U7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms