Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL13Q9P2N7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms