Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PHRF1Q9P1Y6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PHRF1Q9P1Y6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms