Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXXC1Q9P0U4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms