Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAPAQ9P0L0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAPAQ9P0L0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms