Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMCD1Q9NZU5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMCD1Q9NZU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms