Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPG21Q9NZD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPG21Q9NZD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPG21Q9NZD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms