Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKIRAS1Q9NYS0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms