Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VNN3Q9NY84 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms