Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMPD3Q9NY59 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMPD3Q9NY59 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms