Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MED29Q9NX70 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms