Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC28Q9NX36 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC28Q9NX36 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms