Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT4Q9NX09 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT4Q9NX09 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms