Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRMT13Q9NUP7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms