Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMBRD1Q9NUN5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMBRD1Q9NUN5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMBRD1Q9NUN5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms