Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GINM1Q9NU53 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GINM1Q9NU53 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GINM1Q9NU53 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms