Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP7BPQ9NSQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP7BPQ9NSQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms