Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOPORSQ9NS56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms