Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RASSF1Q9NS23 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RASSF1Q9NS23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RASSF1Q9NS23 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms