Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1BQ9NQG5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms