Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM138Q9NPI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms