Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
XAB2Q9HCS7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XAB2Q9HCS7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms