Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF2Q9HAK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF2Q9HAK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms