Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD3Q9H7E2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms