Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSS3Q9H6R3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms