Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRDM12Q9H4Q4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 909.5 ms