Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRN3Q9H3W5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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