Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM39BQ9GZU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms