Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SENP6Q9GZR1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SENP6Q9GZR1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms