Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCSER1Q9C0I3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCSER1Q9C0I3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms