Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XPO4Q9C0E2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPO4Q9C0E2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms