Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM55Q9BYV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM55Q9BYV6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms