Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A5Q9BY07 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC4A5Q9BY07 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms