Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL25A1Q9BXS0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL25A1Q9BXS0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL25A1Q9BXS0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms