Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY3Q9BT09 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY3Q9BT09 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms